Las líneas de investigación del programa son:
- Caracterización de materiales y estructuras
- Prospección y caracterización del medio geológico
- Minería sostenible
- Purificación y descontaminación de gases
- Inertización y descontaminación de residuos sólidos
- Modelización de la contaminación atmosférica
- Simulación numérica en ciencias de la tierra
- Hidrogeología estocástica
- Gestión de residuos radiactivos
- Caracterización de emplazamientos contaminados
- Evaluación de riesgos ambientales
- Geoquímica urbana
- Biodiesel: producción, caracterización y emisiones
- Hidrocarburos aromáticos policíclicos en combustibles
- Patrimonio industrial y minero
- Almacenamiento de CO2
- Geoquímica Ambiental
- Paleoambiente
- Química Verde
- Desarrollos metodológicos en materia de estadísticas
- Muestreo de áreas y estadística espacial
- SIG y Teledetección aplicados al medio ambiente
